Bettina Auer studierte Musiktheater-Regie sowie Musikwissenschaft und Germanistik in Hamburg und Berlin. Neben festen Engagements als Musikdramaturgin bzw. Chefdramaturgin an den Theatern in Bern, Darmstadt, Basel und an der Komischen Oper Berlin betreute sie Inszenierungen und Projekte in Schauspiel und Tanz, wobei sie zahlreiche Uraufführungen konzeptionell mitentwickelte. In dieser Zeit gastierte sie auch am Opernhaus Zürich, Burgtheater Wien, Schauspiel Köln, an der Deutschen Oper Berlin und beim Israel Festival. Seit 2009 verbindet sie eine enge Zusammenarbeit mit Calixto Bieito. Darüber hinaus war sie Partnerin zahlreicher Regisseur:innen, unter ihnen Stefan Bachmann, Karin Beier, Tatjana Gürbaca, Claus Guth, Jasmina Hadziahmetovič, Barbora Horáková, Barrie Kosky, Hans Neuenfels, Stefan Pucher, Nicolas Stemann und Michael Thalheimer. Seit 2012 arbeitet sie freischaffend als Produktionsdramaturgin u. a. an De Nationale Opera, der Vlaamse Opera, bei den Salzburger Festspielen, den Berliner Philharmonikern, Den Norske Opera, am Theater an der Wien, Teatro Argentino, Residenztheater in München, Grand Théâtre de Genève, Teatro Arriaga in Bilbao, an der Staatsoper Unter den Linden, der Deutschen Oper am Rhein, der Wiener Staatsoper, der Bayerischen Staatsoper, der Hamburgischen Staatsoper und der Opéra national de Paris. Bettina Auer lehrt seit vielen Jahren an der »Hanns Eisler« Hochschule Berlin (in der Regie- und der Dramaturgie-Klasse), von der sie kürzlich zur Honorarprofessorin ernannt wurde.