Bettina Auer, geboren in Heidelberg, lebt in Berlin. Sie studierte Musiktheater-Regie sowie Musikwissenschaften und Germanistik in Hamburg und Berlin. Neben festen Engagements als Musikdramaturgin bzw. Chef-Dramaturgin an den Theatern in Bern, Darmstadt, Basel und an der Komischen Oper Berlin betreute sie Inszenierungen und Projekte in Schauspiel und Tanz, wobei sie zahlreiche Uraufführungen konzeptionell mitentwickelte. In dieser Zeit gastierte sie auch am Opernhaus Zürich, Burgtheater Wien, an der Deutschen Oper Berlin, beim Israel Festival in Jerusalem und am Schauspiel Köln.
Seit 2009 verbindet Bettina Auer eine enge Zusammenarbeit mit Calixto Bieito. Darüber hinaus war sie Partnerin zahlreicher Regisseurinnen und Regisseure, unter ihnen Stefan Bachmann, Karin Beier, Tatjana Gürbaca, Claus Guth, Jasmina Hadziahmetovic, Barrie Kosky, Hans Neuenfels, Stefan Pucher, Nicolas Stemann und Michael Thalheimer.
Seit 2012 arbeitet sie freischaffend als Produktionsdramaturgin u. a. an der Oper Amsterdam, am Teatro Argentino, an der Oper Antwerpen, bei den Salzburger Festspielen, den Berliner Philharmonikern, am Nationaltheater Oslo, Theater an der Wien, an der Oper Oslo, der Wiener Staatsoper, der Bayerischen Staatsoper, am Teatro Arriaga in Bilbao, an der Hamburgischen Staatsoper und an der Opéra national de Paris.
Bettina Auer war Gastdozentin an Hochschulen in Frankfurt, Heidelberg, Leipzig und Dresden. Zurzeit lehrt sie an der Hochschule für Musik »Hanns Eisler« und an der Universität der Künste Berlin.